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Genomic Epidemiology (GWAS) (2018)
과정소개
* GWAS에 대한 이해를 바탕으로 PLINK 프로그램 사용법과, 다양한 기능 분석법에 대해 학습한다.
* 의학연구자료 분석을 위한 기초 방법론에 대해 학습한다.
* 유전연계분석(Genetic association analysis)의 이해를 위한 기초 이론을 학습한다.
* 메타분석에 대한 전반적인 이론을 습득하고, 실습을 통해 메타분석에 대해 학습한다.
* GWAS1: 전장유전체분석법에 대한 이해와 PLINK 기본적인이용법 소개, PLINK 분석단계 중 Sample과 marker의 QC방법 안내
* GWAS2: PLINK 분석단계 중, allele frequency 계산법과 HWE 계산법 안내, 결과 분석방법 소개
* GWAS3: PLINK 결과를 HaploView을 이용하여 확인하는 방법 소개
* 역학개론1: 의학 연구에서 원인적 연관성의 기준에 대한 이해
* 역학개론2: 의학 연구 설계의 몇 가지 사례 소개
* 역학개론3: 코호트 연구에서 계산 가능한 지표와 그 의미 소개
* 유전연계분석의 이해: Genetic association analysis의 이해를 돕기 위한 기초적인 이론 소개
* 메타분석: 유전체 역학 분야에서 사용되는 기법인 메타분석 실습
(본 강의는 연자 사정으로 인하여 별도의 강의자료를 제공해드리지 않고 있습니다)
학습목표
* GWAS에 대한 이론을 바탕으로, PLINK 사용법을 이해하고 HaploView를 통해 결과를 확인하는 전체 과정을 습득한다.
* 역학연구에서 원인적 연관성의 판정기준을 이해한다. 역학연구 설계의 방법과 특성을 이해한다. 연관성 지표를 설명할 수 있다.
* 유전역학에서 쓰이는 주요 용어 및 이론을 이해한다. 유전자료 분석, 연계분석, Hardy-Weinberg equilibrium 및 linkage disequilibrium을 이해한다.
* 메타분석에 대한 이론지식을 학습하고, 실습을 통해 이해를 돕는다.
* 역학연구에서 원인적 연관성의 판정기준을 이해한다. 역학연구 설계의 방법과 특성을 이해한다. 연관성 지표를 설명할 수 있다.
* 유전역학에서 쓰이는 주요 용어 및 이론을 이해한다. 유전자료 분석, 연계분석, Hardy-Weinberg equilibrium 및 linkage disequilibrium을 이해한다.
* 메타분석에 대한 이론지식을 학습하고, 실습을 통해 이해를 돕는다.
강의목차
차시 | 강의명 |
---|---|
1차시 | Genomic Epidemiology/GWAS1-QC-(경희대 임지은) |
2차시 | Genomic Epidemiology/GWAS2_MAF-qt-means-(경희대 임지은) |
3차시 | Genomic Epidemiology/GWAS3_haploview-publicDB-(경희대 임지은) |
4차시 | Genomic Epidemiology/역학개론_1강-김미경(10min) |
5차시 | Genomic Epidemiology/역학개론_2강-김미경(29min) |
6차시 | Genomic Epidemiology/역학개론_3강-김미경(17min) |
7차시 | Genomic Epidemiology/유전연계분석의 이해_기본 이론-서영주(16min) |
8차시 | Genomic Epidemiology/메타분석-홍은표(52min) |